La collection comprend plus de 5000 oeuvres d’Alberto Giacometti dont 95 peintures, 260 bronzes et 550 plâtres, des milliers de dessins et de gravures. Elle renferme 4 600 photographies ainsi que quelques œuvres d’artistes (Miró, Ernst notamment) données au couple Giacometti. Le fonds comprend également l’ensemble de l’atelier parisien de Giacometti, ses célèbres murs peints et ses meubles, ainsi que la bibliothèque de l’artiste.
La collection des oeuvres d’Alberto Giacometti est progressivement mise en ligne sur le catalogue en ligne.
Elle n’est pas visible dans les locaux de la Fondation mais est présentée dans de nombreuses expositions et prêts extérieurs.